Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms