Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OC90Q02509 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OC90Q02509 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OC90Q02509 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OC90Q02509 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OC90Q02509 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OC90Q02509 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OC90Q02509 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OC90Q02509 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OC90Q02509 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OC90Q02509 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OC90Q02509 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OC90Q02509 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
OC90Q02509 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
OC90Q02509 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
OC90Q02509 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
OC90Q02509 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
OC90Q02509 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
OC90Q02509 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
OC90Q02509 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
OC90Q02509 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OC90Q02509 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms