Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms