Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms