Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX6P78412 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX6P78412 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX6P78412 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX6P78412 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX6P78412 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX6P78412 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX6P78412 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX6P78412 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX6P78412 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX6P78412 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX6P78412 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms