Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms