Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms