Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATN1P54259 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATN1P54259 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATN1P54259 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATN1P54259 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATN1P54259 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATN1P54259 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATN1P54259 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATN1P54259 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATN1P54259 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATN1P54259 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATN1P54259 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATN1P54259 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATN1P54259 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATN1P54259 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATN1P54259 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms