Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSFMP43897 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSFMP43897 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSFMP43897 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms