Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms