Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD13P35453 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms