Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BMI1P35226 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BMI1P35226 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BMI1P35226 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BMI1P35226 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BMI1P35226 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BMI1P35226 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BMI1P35226 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BMI1P35226 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms