Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
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