Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms