Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms