Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms