Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms