Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms