Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPI1P17947 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms