Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA1P17302 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA1P17302 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA1P17302 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA1P17302 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA1P17302 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA1P17302 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA1P17302 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA1P17302 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA1P17302 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA1P17302 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA1P17302 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA1P17302 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA1P17302 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA1P17302 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms