Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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