Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOP08100 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOP08100 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOP08100 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHOP08100 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms