Protein–RNA interactions for Protein: P04436

T-cell receptor alpha chain V region HPB-MLT (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04436 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04436 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04436 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04436 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04436 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04436 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P04436 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P04436 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P04436 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P04436 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P04436 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P04436 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P04436 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P04436 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P04436 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P04436 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04436 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04436 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04436 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04436 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04436 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04436 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04436 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04436 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04436 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04436 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04436 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P04436 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P04436 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms