Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms