Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC24DO94855 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC24DO94855 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC24DO94855 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC24DO94855 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC24DO94855 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC24DO94855 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC24DO94855 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC24DO94855 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC24DO94855 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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SEC24DO94855 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC24DO94855 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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SEC24DO94855 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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SEC24DO94855 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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SEC24DO94855 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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SEC24DO94855 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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SEC24DO94855 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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SEC24DO94855 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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SEC24DO94855 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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SEC24DO94855 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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