Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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