Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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PDE6DO43924 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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PDE6DO43924 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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PDE6DO43924 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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PDE6DO43924 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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PDE6DO43924 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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PDE6DO43924 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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PDE6DO43924 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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PDE6DO43924 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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