Protein–RNA interactions for Protein: O43918

AIRE, Autoimmune regulator, humanhuman

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIREO43918 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIREO43918 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIREO43918 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIREO43918 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIREO43918 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIREO43918 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIREO43918 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIREO43918 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIREO43918 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIREO43918 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIREO43918 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIREO43918 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIREO43918 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIREO43918 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIREO43918 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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