Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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