Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SGSM2O43147 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms