Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms