Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H7C1D1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H7C1D1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H7C1D1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H7C1D1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H7C1D1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H7C1D1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H7C1D1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H7C1D1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
H7C1D1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1D1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1D1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1D1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H7C1D1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H7C1D1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms