Protein–RNA interactions for Protein: F8WFD2

NPIPA3, Nuclear pore complex-interacting protein family member A3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA3F8WFD2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPA3F8WFD2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms