Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.3 ms