Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms