Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms