Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms