Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms