Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms