Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DXG7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DXG7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms