Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8B2A6NJW9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms