Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms