Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms