Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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AFG3L2Q9Y4W6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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AFG3L2Q9Y4W6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AFG3L2Q9Y4W6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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