Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms