Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms