Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms