Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms