Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms