Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK3Q9UBP4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms